More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4387 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
323 aa  634    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  88.34 
 
 
173 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  85.8 
 
 
170 aa  305  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  86.08 
 
 
291 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.12 
 
 
188 aa  288  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.01 
 
 
188 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  72.92 
 
 
188 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  68.61 
 
 
173 aa  196  6e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  65.47 
 
 
184 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.49 
 
 
176 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  64.29 
 
 
190 aa  190  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  64.29 
 
 
190 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  61.81 
 
 
189 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.67 
 
 
176 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  62.86 
 
 
189 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 
268 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 
264 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  64.23 
 
 
787 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 
268 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  62.14 
 
 
189 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  62.86 
 
 
189 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  62.86 
 
 
190 aa  185  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.28 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.38 
 
 
225 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.94 
 
 
202 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.85 
 
 
251 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
160 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
160 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  60.45 
 
 
222 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  60.45 
 
 
222 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.75 
 
 
183 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
179 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
179 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
179 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
179 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
172 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
172 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
172 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
172 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
172 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.09 
 
 
200 aa  176  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
172 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
172 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
172 aa  175  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  60.9 
 
 
211 aa  175  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  56.03 
 
 
185 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  49.43 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.77 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  61.65 
 
 
166 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.74 
 
 
170 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.74 
 
 
170 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  60.15 
 
 
191 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
173 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  58.09 
 
 
179 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.42 
 
 
200 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.46 
 
 
200 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.19 
 
 
170 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
172 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.56 
 
 
167 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
173 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
158 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  60.15 
 
 
167 aa  174  2.9999999999999996e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  52.82 
 
 
168 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
173 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 
158 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.65 
 
 
158 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 
158 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  59.56 
 
 
791 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  58.65 
 
 
158 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  54.67 
 
 
213 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  60.15 
 
 
158 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  51.9 
 
 
213 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3570  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.2 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  60.15 
 
 
793 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
224 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.74 
 
 
170 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
225 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
225 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  59.56 
 
 
792 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  58.65 
 
 
158 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
173 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  55.64 
 
 
166 aa  172  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  51.68 
 
 
174 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
170 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  58.52 
 
 
224 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  50.29 
 
 
225 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1924  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.2 
 
 
322 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  50.29 
 
 
225 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  56.62 
 
 
220 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  58.65 
 
 
175 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>