More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2252 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  68.97 
 
 
184 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65 
 
 
226 aa  231  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  69.93 
 
 
264 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  65.62 
 
 
216 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  66.03 
 
 
182 aa  228  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  67.11 
 
 
183 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  68.53 
 
 
271 aa  225  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  65.38 
 
 
199 aa  224  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.03 
 
 
183 aa  224  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.44 
 
 
179 aa  224  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.77 
 
 
183 aa  224  9e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  62.26 
 
 
182 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  65.1 
 
 
179 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.42 
 
 
180 aa  222  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  62.5 
 
 
183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  60.62 
 
 
178 aa  221  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.75 
 
 
170 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  61.88 
 
 
185 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  66.67 
 
 
184 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.25 
 
 
170 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.25 
 
 
170 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.58 
 
 
181 aa  216  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  65.1 
 
 
184 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  58.75 
 
 
184 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  66.2 
 
 
184 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  64 
 
 
174 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  65.97 
 
 
226 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  60.62 
 
 
183 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  66.2 
 
 
184 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  65.49 
 
 
184 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  65.28 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  65.49 
 
 
184 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.28 
 
 
183 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.63 
 
 
184 aa  214  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  60 
 
 
170 aa  214  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.01 
 
 
169 aa  214  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.19 
 
 
184 aa  214  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.89 
 
 
202 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
179 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.96 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  58.75 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  59.12 
 
 
792 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  60.65 
 
 
791 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.64 
 
 
230 aa  208  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.95 
 
 
183 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  59.49 
 
 
167 aa  207  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 
268 aa  206  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
268 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.67 
 
 
169 aa  206  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  56.47 
 
 
172 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
167 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.69 
 
 
794 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  60.78 
 
 
171 aa  205  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.59 
 
 
793 aa  205  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
179 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
179 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
179 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  59.62 
 
 
167 aa  204  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  61.59 
 
 
264 aa  204  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
172 aa  204  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
172 aa  204  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
172 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
172 aa  204  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
172 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
213 aa  203  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 
172 aa  203  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 
169 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.41 
 
 
794 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 
172 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  61.04 
 
 
160 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  61.04 
 
 
160 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.28 
 
 
200 aa  201  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.06 
 
 
200 aa  201  9e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.89 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  60.96 
 
 
168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.45 
 
 
191 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 
173 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.31 
 
 
159 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  57.67 
 
 
170 aa  199  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
169 aa  199  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.31 
 
 
159 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  55.7 
 
 
170 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  59.31 
 
 
159 aa  198  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  57.82 
 
 
250 aa  197  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
170 aa  197  7e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
166 aa  197  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.66 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  59.59 
 
 
165 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  54.43 
 
 
170 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.13 
 
 
794 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  57.93 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  58 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>