More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1606 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  93.68 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  88.89 
 
 		 189 aa  356  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  89.95 
 
 		 190 aa  356  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  88.89 
 
 		 189 aa  356  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  88.36 
 
 		 189 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  86.24 
 
 		 189 aa  338  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.87 
 
 		 176 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  74.05 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.85 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  68.18 
 
 		 173 aa  240  7.999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.13 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.52 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  60.76 
 
 		 264 aa  202  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.9 
 
 		 170 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  56.97 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  62.33 
 
 		 172 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  57.49 
 
 		 268 aa  198  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 		 174 aa  198  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  57.83 
 
 		 173 aa  197  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 172 aa  197  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 170 aa  197  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 		 172 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 245 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  57.64 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 		 250 aa  195  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.36 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  58.9 
 
 		 172 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.52 
 
 		 167 aa  194  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  60.54 
 
 		 158 aa  194  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  60.54 
 
 		 158 aa  194  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.41 
 
 		 158 aa  194  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  55.03 
 
 		 244 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 		 247 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  55.03 
 
 		 244 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  54.25 
 
 		 246 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  54 
 
 		 250 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.49 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5810  NADH dehydrogenase subunit B  57.79 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  55.03 
 
 		 244 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  53.69 
 
 		 250 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  53.69 
 
 		 250 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  55.03 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  65.71 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.49 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.11 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0779  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.348206  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  53.33 
 
 		 249 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  54 
 
 		 244 aa  191  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 		 167 aa  192  4e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  53.33 
 
 		 249 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  55.77 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  53.69 
 
 		 235 aa  191  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  59.31 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 		 191 aa  191  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 194 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.28 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 		 159 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.06 
 
 		 169 aa  191  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 194 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 		 170 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.78 
 
 		 170 aa  191  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  65.71 
 
 		 173 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 		 186 aa  191  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 		 190 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.7 
 
 		 158 aa  190  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 		 193 aa  190  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.29 
 
 		 323 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  53.69 
 
 		 252 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  60.28 
 
 		 158 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  60.28 
 
 		 158 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 		 158 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 		 159 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  58.5 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>