More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5969 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  85.25 
 
 		 188 aa  317  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  84.7 
 
 		 188 aa  316  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  81.13 
 
 		 173 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.88 
 
 		 323 aa  278  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  81.82 
 
 		 170 aa  273  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.14 
 
 		 291 aa  273  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  61.69 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  59.59 
 
 		 268 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  59.59 
 
 		 268 aa  194  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 264 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.71 
 
 		 176 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.56 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  58.82 
 
 		 190 aa  188  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 		 190 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 		 189 aa  187  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 		 190 aa  187  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  60.56 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 		 251 aa  185  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  57.79 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.33 
 
 		 170 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.06 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.67 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  55.13 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  55.13 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.74 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.04 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  49.41 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.15 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  52.76 
 
 		 224 aa  177  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.45 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  48.28 
 
 		 264 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.65 
 
 		 170 aa  177  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.94 
 
 		 169 aa  177  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  55 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  56.34 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  60.15 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4120  NADH dehydrogenase subunit B  51.79 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  52.15 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1745  NADH dehydrogenase subunit B  51.79 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440453  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  51.28 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.29 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  56.34 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  51.3 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1872  NADH dehydrogenase subunit B  52.76 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  0.231818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  55.07 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 225 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  58.65 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 191 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3692  NADH dehydrogenase subunit B  52.76 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.779049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 225 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.88 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  52.15 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 172 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  53.64 
 
 		 174 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 172 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 		 170 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 172 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 172 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 172 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 172 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 		 172 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.72 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.43 
 
 		 191 aa  174  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  58.7 
 
 		 787 aa  174  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  55.07 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  55.07 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 		 177 aa  174  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  54.23 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>