More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3629 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 176 aa  369  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  77.27 
 
 		 184 aa  268  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  75.97 
 
 		 173 aa  264  5e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  72.85 
 
 		 190 aa  247  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  72.85 
 
 		 190 aa  247  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  73.29 
 
 		 189 aa  245  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  71.62 
 
 		 189 aa  243  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  72.6 
 
 		 189 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  73.29 
 
 		 189 aa  241  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  72.6 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.84 
 
 		 158 aa  207  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.53 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  60.53 
 
 		 158 aa  204  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 		 158 aa  204  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 		 159 aa  204  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 		 159 aa  204  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 		 159 aa  204  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 		 160 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 		 160 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  58.86 
 
 		 158 aa  204  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 		 160 aa  203  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 173 aa  203  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 173 aa  203  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 173 aa  203  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 		 158 aa  203  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.18 
 
 		 158 aa  203  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 		 160 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  55.95 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 158 aa  201  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 158 aa  201  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  59.24 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 158 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 158 aa  198  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 158 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 		 159 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 160 aa  197  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 160 aa  197  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 172 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.96 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  60.99 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  60.78 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.78 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  60.78 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  60.84 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  63.45 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  59.73 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  65.22 
 
 		 158 aa  195  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  65.22 
 
 		 158 aa  195  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 158 aa  194  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  62.67 
 
 		 170 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 		 188 aa  194  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.6 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 173 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 173 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 175 aa  193  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  55.06 
 
 		 186 aa  193  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  54.6 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.38 
 
 		 291 aa  191  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 167 aa  191  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  52.38 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.14 
 
 		 167 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 167 aa  191  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  56.21 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>