More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3080 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  81.66 
 
 
174 aa  297  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  76.19 
 
 
167 aa  277  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  80.13 
 
 
167 aa  276  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  64.57 
 
 
184 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  62.15 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 
264 aa  231  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  68.83 
 
 
182 aa  231  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
271 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.31 
 
 
226 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.45 
 
 
183 aa  227  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  61.24 
 
 
183 aa  226  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  67.55 
 
 
182 aa  225  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  58.99 
 
 
184 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  61.14 
 
 
185 aa  225  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.6 
 
 
181 aa  224  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.86 
 
 
180 aa  224  4e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  68.21 
 
 
199 aa  222  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  58.99 
 
 
183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  66.45 
 
 
183 aa  220  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.8 
 
 
184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  61.11 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.11 
 
 
184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.9 
 
 
179 aa  217  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.23 
 
 
183 aa  217  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  64.74 
 
 
226 aa  216  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.61 
 
 
183 aa  216  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  64.1 
 
 
226 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  59.43 
 
 
184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  59.43 
 
 
184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  59.43 
 
 
184 aa  214  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.01 
 
 
184 aa  213  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
213 aa  214  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  59.35 
 
 
178 aa  213  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  64.71 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  64.71 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  57.32 
 
 
168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.54 
 
 
183 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 
184 aa  208  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  59.35 
 
 
170 aa  207  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  58.71 
 
 
170 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.71 
 
 
170 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.06 
 
 
170 aa  204  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.42 
 
 
170 aa  204  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.56 
 
 
791 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 
159 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.12 
 
 
202 aa  202  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
172 aa  201  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.64 
 
 
183 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  201  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  201  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 
200 aa  200  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
159 aa  200  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.18 
 
 
200 aa  199  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.86 
 
 
792 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
167 aa  198  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  61.49 
 
 
172 aa  198  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  59.24 
 
 
170 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  60.65 
 
 
158 aa  197  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  60.65 
 
 
158 aa  197  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  60.65 
 
 
158 aa  197  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.34 
 
 
793 aa  197  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  60.65 
 
 
158 aa  197  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.93 
 
 
794 aa  197  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.18 
 
 
200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.74 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  59.35 
 
 
158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.34 
 
 
794 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 
169 aa  195  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  57.96 
 
 
184 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
160 aa  194  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
160 aa  194  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  59.21 
 
 
173 aa  194  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 
193 aa  194  8.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  61.64 
 
 
158 aa  193  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
158 aa  193  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
171 aa  193  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.46 
 
 
170 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  56.13 
 
 
228 aa  192  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.59 
 
 
158 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
166 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.63 
 
 
169 aa  192  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.87 
 
 
158 aa  192  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1543  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.67 
 
 
175 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  55.77 
 
 
190 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  60.96 
 
 
158 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
264 aa  191  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  55.77 
 
 
190 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>