More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0846 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  86.54 
 
 
323 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  82.28 
 
 
173 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  83.44 
 
 
170 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  90.07 
 
 
188 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  90.71 
 
 
188 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  75.14 
 
 
188 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  67.15 
 
 
173 aa  195  9e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  63.89 
 
 
189 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  57.59 
 
 
268 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.77 
 
 
176 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.38 
 
 
176 aa  191  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  63.83 
 
 
184 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  56.96 
 
 
268 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  63.31 
 
 
189 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  63.31 
 
 
190 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  63.31 
 
 
189 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  63.31 
 
 
190 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  62.59 
 
 
189 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.86 
 
 
183 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  61.7 
 
 
787 aa  185  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  61.87 
 
 
190 aa  185  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  59.03 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.31 
 
 
251 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
250 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.85 
 
 
225 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  60.9 
 
 
211 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
160 aa  178  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
160 aa  178  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
222 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  59.7 
 
 
222 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.03 
 
 
202 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.94 
 
 
170 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.32 
 
 
191 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  60.45 
 
 
222 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
179 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
179 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
179 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  58.27 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.45 
 
 
158 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.74 
 
 
158 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.88 
 
 
170 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.88 
 
 
170 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56 
 
 
200 aa  175  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  45.83 
 
 
271 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 
173 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  46.49 
 
 
264 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.74 
 
 
158 aa  175  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  55.32 
 
 
158 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  51.61 
 
 
158 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  51.61 
 
 
158 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 
172 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 
173 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  56.03 
 
 
159 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.7 
 
 
170 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  48.26 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  53.1 
 
 
179 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 
173 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 
170 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  58.65 
 
 
175 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  55.32 
 
 
159 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  57.25 
 
 
191 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  56.74 
 
 
158 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 
174 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 
176 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  58.65 
 
 
177 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.97 
 
 
792 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  56.12 
 
 
224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.03 
 
 
159 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  56.03 
 
 
158 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  59.4 
 
 
166 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  56.03 
 
 
158 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  57.35 
 
 
220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  50.64 
 
 
174 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  55.32 
 
 
158 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.45 
 
 
791 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  55.47 
 
 
173 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  58.65 
 
 
167 aa  173  3.9999999999999995e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 
174 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  55.32 
 
 
158 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>