More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2569 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
225 aa  470  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  99.56 
 
 
225 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4120  NADH dehydrogenase subunit B  92 
 
 
225 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3692  NADH dehydrogenase subunit B  91.56 
 
 
225 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.779049  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1745  NADH dehydrogenase subunit B  92 
 
 
225 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440453  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1872  NADH dehydrogenase subunit B  92 
 
 
225 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  0.231818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28450  NADH dehydrogenase subunit B  92 
 
 
224 aa  440  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3366  NADH dehydrogenase I, B subunit  92 
 
 
224 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3604  NADH dehydrogenase subunit B  92.44 
 
 
224 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  91.56 
 
 
224 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  89.78 
 
 
225 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3131  NADH dehydrogenase subunit B  82.82 
 
 
226 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1493  NADH dehydrogenase subunit B  78.22 
 
 
224 aa  387  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2771  NADH dehydrogenase subunit B  77.78 
 
 
224 aa  384  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1020  NADH dehydrogenase subunit B  80 
 
 
224 aa  384  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  77.78 
 
 
224 aa  384  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  76.44 
 
 
225 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  76.44 
 
 
225 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  75.56 
 
 
224 aa  377  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2549  NADH dehydrogenase subunit B  76.44 
 
 
224 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1395  NADH dehydrogenase subunit B  76.44 
 
 
224 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  77.33 
 
 
220 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1455  NADH dehydrogenase subunit B  75.77 
 
 
227 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0380  NADH dehydrogenase subunit B  70.22 
 
 
224 aa  346  2e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.8672  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  70.22 
 
 
222 aa  343  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  70.67 
 
 
222 aa  342  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  70.22 
 
 
222 aa  342  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  71.79 
 
 
212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1014  NADH dehydrogenase subunit B  68.66 
 
 
221 aa  300  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0717  NADH dehydrogenase subunit B  61.78 
 
 
211 aa  295  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  63.51 
 
 
213 aa  294  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3824  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.31 
 
 
212 aa  287  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1119  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.15 
 
 
231 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.722994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.73 
 
 
213 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1348  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 
208 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  68.52 
 
 
793 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  65.32 
 
 
791 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  66.67 
 
 
792 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4070  NADH dehydrogenase subunit B  59.8 
 
 
205 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1737  NADH dehydrogenase subunit B  62.92 
 
 
205 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865113  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0101  NADH dehydrogenase subunit B  62.92 
 
 
205 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  65.06 
 
 
794 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1690  NADH dehydrogenase subunit B  61.67 
 
 
205 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  64.46 
 
 
794 aa  234  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1327  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
208 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4742  NADH dehydrogenase subunit B  57.81 
 
 
208 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  67.97 
 
 
787 aa  222  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  62.2 
 
 
794 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.9 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.22 
 
 
170 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 
202 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.54 
 
 
170 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  52.26 
 
 
168 aa  191  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
213 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.53 
 
 
179 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.22 
 
 
169 aa  188  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  53.37 
 
 
179 aa  187  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  54.11 
 
 
174 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  57.82 
 
 
170 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.14 
 
 
170 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
180 aa  185  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
178 aa  185  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  50.89 
 
 
216 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.27 
 
 
191 aa  184  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  55.35 
 
 
250 aa  184  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  52.74 
 
 
179 aa  184  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.1 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  56.85 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  54.55 
 
 
173 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  54.11 
 
 
167 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  60.74 
 
 
268 aa  181  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  60.74 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
183 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  54.86 
 
 
182 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 
159 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  57.75 
 
 
159 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  53.9 
 
 
264 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  53.42 
 
 
167 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.59 
 
 
196 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 
159 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 
159 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
184 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  57.97 
 
 
171 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  55.24 
 
 
167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 
159 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  54.61 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.62 
 
 
194 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>