More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3411 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  79.89 
 
 
184 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1051  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.88 
 
 
190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  52.29 
 
 
167 aa  184  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.69 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.69 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  55.48 
 
 
170 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  55.48 
 
 
170 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  52.05 
 
 
170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 
172 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.29 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.93 
 
 
169 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  46.99 
 
 
173 aa  177  8e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
179 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
179 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
179 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 
170 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
172 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
172 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
172 aa  175  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
172 aa  175  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
172 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
172 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  53.19 
 
 
169 aa  175  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 
172 aa  175  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  53.64 
 
 
173 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.45 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  52.32 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.51 
 
 
291 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.99 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.66 
 
 
323 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  48.25 
 
 
166 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.36 
 
 
183 aa  171  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  49.03 
 
 
158 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  49.03 
 
 
158 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  50.68 
 
 
211 aa  169  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
158 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.8 
 
 
188 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
158 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.43 
 
 
188 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  51.43 
 
 
188 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
177 aa  168  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.06 
 
 
169 aa  168  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
179 aa  167  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.56 
 
 
251 aa  167  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  47.13 
 
 
167 aa  166  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.45 
 
 
158 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  46.26 
 
 
250 aa  166  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  49.66 
 
 
158 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.61 
 
 
176 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  50.36 
 
 
184 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  46.98 
 
 
158 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  46 
 
 
158 aa  165  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  48.95 
 
 
174 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  49.66 
 
 
166 aa  164  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  46 
 
 
249 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  46 
 
 
249 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  47.4 
 
 
158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  48.95 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  49.28 
 
 
177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0200  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.62 
 
 
176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
159 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
177 aa  164  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.92 
 
 
158 aa  164  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  45.16 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1594  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.58 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  45.1 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
268 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  45.16 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  46 
 
 
246 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.52 
 
 
791 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  45.16 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  45.75 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0883  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000571038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.57 
 
 
792 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  47.1 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
268 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  46.53 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  45.1 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  45.1 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  45.1 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.55 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  47.1 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  46.58 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>