More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1444 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
165 aa  347  6e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  91.62 
 
 
167 aa  320  8e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  91.67 
 
 
167 aa  319  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  91.02 
 
 
167 aa  319  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  83.95 
 
 
170 aa  295  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80.98 
 
 
169 aa  293  7e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  83.33 
 
 
170 aa  293  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  79.75 
 
 
169 aa  289  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  74.85 
 
 
169 aa  276  6e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.12 
 
 
179 aa  216  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  59.63 
 
 
179 aa  213  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  60.53 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  63.12 
 
 
158 aa  201  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  63.12 
 
 
158 aa  201  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.62 
 
 
170 aa  200  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.95 
 
 
167 aa  200  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.46 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  59.46 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  57.33 
 
 
250 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
177 aa  198  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.86 
 
 
170 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.17 
 
 
170 aa  197  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  61.7 
 
 
158 aa  197  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  61.7 
 
 
158 aa  197  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
167 aa  197  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
174 aa  197  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  59.59 
 
 
213 aa  197  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 
264 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  56.25 
 
 
170 aa  195  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.28 
 
 
158 aa  195  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.71 
 
 
158 aa  194  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
172 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.56 
 
 
226 aa  194  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  56.38 
 
 
166 aa  194  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
158 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  58.04 
 
 
184 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
172 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
172 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
172 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
172 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
172 aa  194  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 
160 aa  193  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.85 
 
 
183 aa  193  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 
160 aa  193  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
172 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
160 aa  193  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  58.22 
 
 
228 aa  193  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0883  NADH dehydrogenase subunit B  58.87 
 
 
171 aa  193  9e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000571038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  59.31 
 
 
160 aa  193  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
172 aa  193  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  53.5 
 
 
173 aa  193  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  56.49 
 
 
211 aa  193  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
160 aa  192  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  59.44 
 
 
184 aa  193  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  60.28 
 
 
159 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
160 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  60.28 
 
 
159 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  60.28 
 
 
159 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
160 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.57 
 
 
159 aa  192  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  59.15 
 
 
158 aa  192  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  56.38 
 
 
271 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  58.74 
 
 
184 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.94 
 
 
794 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.94 
 
 
794 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  58.87 
 
 
158 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  57.34 
 
 
158 aa  191  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  59.03 
 
 
185 aa  191  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  58.74 
 
 
182 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  58.04 
 
 
184 aa  191  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  57.43 
 
 
216 aa  191  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.42 
 
 
792 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56 
 
 
791 aa  191  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  54.86 
 
 
170 aa  191  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 
183 aa  191  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  58.16 
 
 
159 aa  190  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.77 
 
 
251 aa  190  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
226 aa  190  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
166 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>