More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0910 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  86.36 
 
 		 179 aa  325  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  86.44 
 
 		 179 aa  322  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  70.42 
 
 		 184 aa  235  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  68.42 
 
 		 264 aa  235  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  68.42 
 
 		 271 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.45 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  67.1 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.89 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  64.56 
 
 		 216 aa  227  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  66.67 
 
 		 182 aa  227  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  68.24 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  63.23 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  60.98 
 
 		 183 aa  224  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  66.9 
 
 		 184 aa  223  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  66.9 
 
 		 184 aa  223  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  62.2 
 
 		 183 aa  223  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  65.77 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  66.2 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.66 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.02 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  66.9 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  70.21 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  66.9 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.67 
 
 		 183 aa  221  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  60.62 
 
 		 213 aa  221  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.31 
 
 		 183 aa  220  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.83 
 
 		 169 aa  219  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  64.05 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  62.75 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  64.9 
 
 		 174 aa  218  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.51 
 
 		 184 aa  217  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 		 185 aa  217  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.19 
 
 		 183 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.28 
 
 		 183 aa  216  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  61.69 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  59.35 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  64.19 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 172 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  60.53 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  58.68 
 
 		 172 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 172 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  63.51 
 
 		 167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 		 173 aa  209  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  62.5 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  62.03 
 
 		 170 aa  208  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.39 
 
 		 229 aa  207  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 170 aa  207  9e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 		 250 aa  205  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  58.02 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  62.94 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  59.48 
 
 		 268 aa  204  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  62.24 
 
 		 167 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  62.24 
 
 		 167 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  62.24 
 
 		 167 aa  204  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.67 
 
 		 794 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.62 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.11 
 
 		 169 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 		 159 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.93 
 
 		 170 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  57.05 
 
 		 159 aa  201  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 		 158 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 		 158 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  54.84 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 		 159 aa  200  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 		 159 aa  200  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.19 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.84 
 
 		 792 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.33 
 
 		 791 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.22 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.89 
 
 		 191 aa  198  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  60.4 
 
 		 161 aa  198  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  60.4 
 
 		 161 aa  198  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.33 
 
 		 794 aa  198  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.39 
 
 		 202 aa  198  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 		 264 aa  197  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 		 167 aa  197  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.75 
 
 		 170 aa  197  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  58.45 
 
 		 170 aa  197  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.97 
 
 		 213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.6 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>