More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1296 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  100 
 
 
184 aa  387  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  79.89 
 
 
184 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1051  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.38 
 
 
190 aa  231  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  59.42 
 
 
170 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  56.64 
 
 
170 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.64 
 
 
169 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54 
 
 
170 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54 
 
 
170 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.52 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  50.34 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.33 
 
 
191 aa  169  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  52.78 
 
 
170 aa  168  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  51.77 
 
 
169 aa  167  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  54.01 
 
 
211 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.75 
 
 
176 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  50.65 
 
 
170 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  50.72 
 
 
173 aa  165  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
158 aa  164  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  46.91 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.27 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.7 
 
 
251 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.33 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  48.61 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.28 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.77 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  49.65 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  47.52 
 
 
166 aa  162  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  47.83 
 
 
158 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  50.7 
 
 
268 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  49.02 
 
 
158 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  49.02 
 
 
158 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.67 
 
 
158 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  49.31 
 
 
160 aa  161  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  50.7 
 
 
268 aa  161  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  49.31 
 
 
160 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  49.31 
 
 
160 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  50.36 
 
 
185 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  49.31 
 
 
160 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 
158 aa  160  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  49.33 
 
 
158 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  46.98 
 
 
158 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 
158 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  45.68 
 
 
186 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 
158 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0883  NADH dehydrogenase subunit B  50.75 
 
 
171 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000571038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  51.09 
 
 
158 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  51.82 
 
 
170 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 
174 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  51.09 
 
 
166 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.67 
 
 
158 aa  158  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.22 
 
 
291 aa  158  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  50.7 
 
 
167 aa  158  4e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  48.91 
 
 
177 aa  158  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  48.91 
 
 
176 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  51.09 
 
 
170 aa  158  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  48.91 
 
 
177 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  51.09 
 
 
170 aa  158  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  48.91 
 
 
174 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  47.33 
 
 
160 aa  158  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  47.33 
 
 
160 aa  158  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  45.03 
 
 
240 aa  158  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.91 
 
 
167 aa  158  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 
158 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1743  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
158 aa  157  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  51.82 
 
 
173 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.11 
 
 
791 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  48.55 
 
 
184 aa  157  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  48.18 
 
 
174 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3598  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.01 
 
 
262 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  49.28 
 
 
173 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  44.77 
 
 
244 aa  156  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>