More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1594 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1594  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  70.39 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0200  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.43 
 
 		 176 aa  210  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  67.83 
 
 		 166 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  61.9 
 
 		 268 aa  197  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  55.62 
 
 		 268 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.39 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.54 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  60.53 
 
 		 264 aa  191  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.54 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1206  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.69 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  61.11 
 
 		 173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.62 
 
 		 225 aa  187  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 271 aa  185  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  59.57 
 
 		 216 aa  185  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  60.84 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  59.44 
 
 		 264 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  60.99 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.28 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  58.06 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  59.15 
 
 		 158 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  59.15 
 
 		 158 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.31 
 
 		 158 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1494  NADH dehydrogenase subunit B  59.85 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.72 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  58.87 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  58.71 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.87 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  59.71 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  59.85 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.49 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.84 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.49 
 
 		 170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.82 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.77 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.12 
 
 		 159 aa  178  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  59.42 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.12 
 
 		 159 aa  178  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.58 
 
 		 159 aa  178  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  57.45 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 		 178 aa  178  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.64 
 
 		 793 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  53.46 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  57.34 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.45 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  61.31 
 
 		 158 aa  177  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 		 169 aa  177  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  59.85 
 
 		 158 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 		 159 aa  177  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  55.86 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 		 158 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  55.86 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  59.57 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  58.16 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  56.38 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  58.16 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  57.66 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  59.57 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  55.26 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  57.34 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  59.12 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.87 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.55 
 
 		 794 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  58.87 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.12 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.63 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  60.58 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>