More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2694 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  83.89 
 
 
181 aa  325  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  82.68 
 
 
183 aa  320  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  81.01 
 
 
183 aa  318  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  83.24 
 
 
183 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  80.9 
 
 
184 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  80.34 
 
 
184 aa  307  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  79.43 
 
 
184 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  80.7 
 
 
184 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  80.7 
 
 
184 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  85.44 
 
 
184 aa  294  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.66 
 
 
184 aa  293  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  77.71 
 
 
184 aa  293  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  77.33 
 
 
216 aa  291  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.4 
 
 
184 aa  290  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  83.02 
 
 
182 aa  285  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.39 
 
 
226 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.16 
 
 
184 aa  281  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  78.62 
 
 
199 aa  274  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  75.46 
 
 
182 aa  273  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  73.37 
 
 
226 aa  271  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  70 
 
 
183 aa  270  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  73.96 
 
 
226 aa  270  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.73 
 
 
183 aa  268  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  75.76 
 
 
264 aa  268  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  76.88 
 
 
183 aa  268  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  74.05 
 
 
184 aa  265  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  73.94 
 
 
271 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.98 
 
 
183 aa  256  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.19 
 
 
180 aa  236  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  61.14 
 
 
179 aa  225  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.72 
 
 
179 aa  222  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  64.2 
 
 
167 aa  222  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  64.74 
 
 
167 aa  221  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  63.41 
 
 
174 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  61.88 
 
 
213 aa  220  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  66.9 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 
178 aa  217  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.74 
 
 
202 aa  203  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.84 
 
 
170 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  62 
 
 
173 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.52 
 
 
200 aa  201  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.19 
 
 
170 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
200 aa  201  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  58.6 
 
 
166 aa  200  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 
169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 
200 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  55.19 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.67 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  52.9 
 
 
168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.23 
 
 
229 aa  194  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  54.55 
 
 
170 aa  194  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
171 aa  194  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  59.46 
 
 
170 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
264 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 
167 aa  191  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.28 
 
 
169 aa  189  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.31 
 
 
191 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  49.68 
 
 
187 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
180 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  48.41 
 
 
182 aa  189  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  56.38 
 
 
172 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.99 
 
 
794 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  56.29 
 
 
170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.99 
 
 
794 aa  188  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 
268 aa  187  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  48.75 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 
268 aa  187  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
179 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
179 aa  187  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
179 aa  187  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 
158 aa  187  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  49.37 
 
 
181 aa  187  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
172 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
172 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 
160 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
172 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
172 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.19 
 
 
159 aa  186  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  54.84 
 
 
160 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
172 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 
158 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
172 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
172 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  54.42 
 
 
213 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  52.29 
 
 
159 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  52.29 
 
 
159 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  52.29 
 
 
159 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.67 
 
 
230 aa  185  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 
158 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
159 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  51.32 
 
 
159 aa  185  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 
158 aa  184  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.68 
 
 
794 aa  184  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
169 aa  184  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 
158 aa  184  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 
158 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
160 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>