More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6681 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
182 aa  377  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  85.08 
 
 
199 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  81.87 
 
 
182 aa  323  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  84.78 
 
 
226 aa  317  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  77.84 
 
 
216 aa  304  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  86.45 
 
 
271 aa  292  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  75.14 
 
 
226 aa  289  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  87.42 
 
 
264 aa  289  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  84.18 
 
 
226 aa  287  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  83.97 
 
 
184 aa  284  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  78.53 
 
 
184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.37 
 
 
181 aa  277  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  77.91 
 
 
183 aa  275  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.87 
 
 
184 aa  274  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  75.46 
 
 
185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  78.62 
 
 
184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  74.85 
 
 
183 aa  272  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.69 
 
 
183 aa  271  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.25 
 
 
184 aa  271  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  77.99 
 
 
184 aa  270  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  69.89 
 
 
184 aa  270  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  69.89 
 
 
184 aa  270  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  78.85 
 
 
184 aa  269  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  76.73 
 
 
183 aa  266  8.999999999999999e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.64 
 
 
184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  76.28 
 
 
184 aa  264  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.1 
 
 
183 aa  264  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.21 
 
 
183 aa  260  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.57 
 
 
183 aa  245  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.55 
 
 
180 aa  245  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  64.81 
 
 
174 aa  231  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  66.67 
 
 
178 aa  227  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.57 
 
 
179 aa  226  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  67.55 
 
 
179 aa  225  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  66.22 
 
 
179 aa  225  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  65.56 
 
 
167 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  62.26 
 
 
213 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  64.24 
 
 
167 aa  220  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.35 
 
 
200 aa  214  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.35 
 
 
200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.09 
 
 
169 aa  214  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.78 
 
 
170 aa  214  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.22 
 
 
202 aa  214  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.35 
 
 
200 aa  213  9e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.13 
 
 
170 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.68 
 
 
170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  60.13 
 
 
170 aa  210  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  60.13 
 
 
170 aa  209  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  55.97 
 
 
168 aa  209  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  62.84 
 
 
173 aa  206  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.62 
 
 
169 aa  205  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  62.25 
 
 
160 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  62.25 
 
 
160 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 
159 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 
167 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.01 
 
 
183 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  61.04 
 
 
158 aa  202  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  60.39 
 
 
158 aa  201  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.93 
 
 
158 aa  201  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 
166 aa  200  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  61.59 
 
 
158 aa  200  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
160 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
160 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
160 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.95 
 
 
794 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
268 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.95 
 
 
794 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  59.73 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.93 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  59.73 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  60.84 
 
 
268 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 
159 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
159 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
171 aa  198  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
159 aa  197  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.94 
 
 
158 aa  197  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 
158 aa  197  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  55.95 
 
 
160 aa  197  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 
264 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  60.71 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>