More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1206 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1206  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
175 aa  357  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.12 
 
 
196 aa  258  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  71.72 
 
 
166 aa  224  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  60.14 
 
 
173 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.39 
 
 
191 aa  189  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1594  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.69 
 
 
187 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0200  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.81 
 
 
176 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  57.86 
 
 
172 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
179 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
179 aa  186  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
179 aa  186  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  62.04 
 
 
167 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
174 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 
170 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
172 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
170 aa  185  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  62.04 
 
 
167 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.23 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.41 
 
 
200 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 
268 aa  180  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 
268 aa  180  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  55.06 
 
 
264 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.45 
 
 
200 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 
225 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 
251 aa  179  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  54.19 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  55.94 
 
 
179 aa  177  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 
250 aa  177  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  51.76 
 
 
225 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  51.76 
 
 
225 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  59.7 
 
 
787 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  51.61 
 
 
168 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  53.16 
 
 
249 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3692  NADH dehydrogenase subunit B  51.18 
 
 
225 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.779049  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.47 
 
 
179 aa  175  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  53.16 
 
 
249 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1872  NADH dehydrogenase subunit B  51.18 
 
 
225 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  0.231818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4120  NADH dehydrogenase subunit B  51.18 
 
 
225 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1745  NADH dehydrogenase subunit B  51.18 
 
 
225 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440453  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  58.39 
 
 
179 aa  174  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.34 
 
 
793 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.06 
 
 
181 aa  174  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  56.83 
 
 
182 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.43 
 
 
792 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3366  NADH dehydrogenase I, B subunit  52.94 
 
 
224 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
224 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.31 
 
 
176 aa  172  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  58.16 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.52 
 
 
794 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3604  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.05 
 
 
791 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  54.27 
 
 
244 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  52.38 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  51.74 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3131  NADH dehydrogenase subunit B  52.33 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  53.66 
 
 
245 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.6 
 
 
169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  51.81 
 
 
220 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2771  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
224 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.47 
 
 
226 aa  171  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.82 
 
 
794 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.34 
 
 
158 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  52.44 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  54.17 
 
 
183 aa  170  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.58 
 
 
176 aa  170  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.29 
 
 
183 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 
158 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 
158 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  52.73 
 
 
222 aa  169  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  51.76 
 
 
224 aa  169  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1493  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
224 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195904  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  55.06 
 
 
222 aa  169  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.32 
 
 
170 aa  169  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  54.23 
 
 
159 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  52.73 
 
 
222 aa  169  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  56.46 
 
 
184 aa  169  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  54.23 
 
 
159 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
158 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  55.24 
 
 
158 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>