More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0585 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  87.98 
 
 
183 aa  347  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  82.68 
 
 
183 aa  321  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  81.01 
 
 
185 aa  318  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80.56 
 
 
181 aa  309  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  80.57 
 
 
184 aa  306  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  76.4 
 
 
184 aa  293  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  76.4 
 
 
184 aa  293  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  78.36 
 
 
184 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  78.36 
 
 
184 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.28 
 
 
184 aa  284  5e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  74.29 
 
 
184 aa  284  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.13 
 
 
184 aa  284  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  82.28 
 
 
184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  78.75 
 
 
182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.16 
 
 
184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  75 
 
 
216 aa  281  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.76 
 
 
226 aa  275  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  76.83 
 
 
199 aa  274  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  74.85 
 
 
182 aa  272  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  81.33 
 
 
264 aa  269  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  74.1 
 
 
271 aa  267  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  67.03 
 
 
226 aa  263  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  67.58 
 
 
226 aa  262  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  73.58 
 
 
183 aa  257  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.96 
 
 
183 aa  256  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  70.89 
 
 
184 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.14 
 
 
183 aa  250  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.34 
 
 
183 aa  248  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.47 
 
 
180 aa  236  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  60.98 
 
 
178 aa  224  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  63.46 
 
 
167 aa  221  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  58.99 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.77 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  62.2 
 
 
174 aa  219  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  65.1 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  62.18 
 
 
167 aa  218  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  60.62 
 
 
213 aa  216  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.97 
 
 
202 aa  204  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  56.58 
 
 
168 aa  204  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.37 
 
 
170 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.37 
 
 
170 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.35 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  53.46 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  54.09 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.94 
 
 
200 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 
200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  50.96 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  51.59 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.67 
 
 
230 aa  195  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.33 
 
 
200 aa  195  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.83 
 
 
169 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  54.66 
 
 
172 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
179 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
172 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 
172 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  49.37 
 
 
180 aa  191  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 
173 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
180 aa  191  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  54.68 
 
 
181 aa  190  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 
170 aa  190  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.22 
 
 
183 aa  190  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  53.99 
 
 
170 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  54.43 
 
 
171 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.36 
 
 
181 aa  189  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  54.66 
 
 
160 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 
159 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  53.95 
 
 
159 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  54.66 
 
 
160 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.45 
 
 
169 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  55.92 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  52.63 
 
 
159 aa  187  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.19 
 
 
159 aa  187  9e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  52.63 
 
 
159 aa  187  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  54.19 
 
 
158 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.97 
 
 
229 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 
159 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
220 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  51.55 
 
 
160 aa  184  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  52.17 
 
 
160 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>