More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3754 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  81.2 
 
 
250 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  81.2 
 
 
250 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  78.19 
 
 
245 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  78.1 
 
 
244 aa  394  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  75 
 
 
240 aa  374  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  71.67 
 
 
238 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  82.59 
 
 
235 aa  351  5.9999999999999994e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  72.27 
 
 
250 aa  341  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  72.6 
 
 
246 aa  338  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  75.36 
 
 
244 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  72.48 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  73.71 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  72.48 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  76.35 
 
 
252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  71.17 
 
 
244 aa  334  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  71.17 
 
 
244 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  71.62 
 
 
244 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  65.92 
 
 
259 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 
190 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 
190 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 
170 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 
170 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  54.05 
 
 
189 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
190 aa  191  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  52 
 
 
189 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.64 
 
 
176 aa  188  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  49.38 
 
 
189 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  52.47 
 
 
168 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.9 
 
 
169 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  54.61 
 
 
170 aa  184  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.29 
 
 
170 aa  184  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  49.69 
 
 
173 aa  183  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  53.95 
 
 
170 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.63 
 
 
169 aa  183  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  48.12 
 
 
184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
170 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.81 
 
 
791 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  49.44 
 
 
250 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.07 
 
 
794 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 
225 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  50.93 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  42.13 
 
 
793 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.6 
 
 
794 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
166 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.31 
 
 
202 aa  178  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 
170 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  50.66 
 
 
172 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.09 
 
 
794 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.63 
 
 
226 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  56.55 
 
 
170 aa  176  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  58.74 
 
 
193 aa  176  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.09 
 
 
792 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
165 aa  176  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  50.66 
 
 
172 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  47.46 
 
 
271 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.66 
 
 
176 aa  175  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  50 
 
 
228 aa  175  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.32 
 
 
167 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  48.19 
 
 
179 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  48.19 
 
 
179 aa  175  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  48.19 
 
 
179 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
167 aa  175  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.06 
 
 
183 aa  174  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
167 aa  174  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  50.33 
 
 
160 aa  174  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  50.33 
 
 
160 aa  174  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
167 aa  174  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
172 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
172 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
172 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
172 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
172 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  44.75 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.32 
 
 
200 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
172 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.32 
 
 
200 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  52.08 
 
 
167 aa  173  1.9999999999999998e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  55.17 
 
 
170 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.32 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  46.47 
 
 
182 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  48.17 
 
 
179 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  49.37 
 
 
182 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  51.28 
 
 
169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  46.91 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  50.7 
 
 
166 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  58.57 
 
 
170 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  50.64 
 
 
178 aa  171  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  53.25 
 
 
173 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3598  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.37 
 
 
262 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1924  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.37 
 
 
322 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  49.02 
 
 
174 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  47.74 
 
 
226 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  48.15 
 
 
184 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  51.75 
 
 
167 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0954  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.37 
 
 
322 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>