More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0231 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 244 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  92.41 
 
 		 246 aa  441  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  82.72 
 
 		 250 aa  410  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  87.5 
 
 		 252 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  84.93 
 
 		 249 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  84.93 
 
 		 249 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  82.95 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  83.57 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  84.95 
 
 		 244 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  83.73 
 
 		 244 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  74.88 
 
 		 250 aa  348  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  74.88 
 
 		 250 aa  348  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  73.06 
 
 		 247 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  78.28 
 
 		 235 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  78.06 
 
 		 240 aa  337  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  76.88 
 
 		 238 aa  334  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  74.75 
 
 		 244 aa  334  7.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  74.26 
 
 		 245 aa  333  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  66.67 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  49.72 
 
 		 190 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  54 
 
 		 190 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  54.36 
 
 		 189 aa  191  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  52.67 
 
 		 190 aa  191  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 		 170 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 		 170 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.11 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 189 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  50.62 
 
 		 168 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  52.67 
 
 		 189 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56 
 
 		 176 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.26 
 
 		 170 aa  188  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.9 
 
 		 169 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  52.67 
 
 		 173 aa  186  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  54.05 
 
 		 184 aa  185  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 189 aa  185  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 		 170 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  55.03 
 
 		 170 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.16 
 
 		 202 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  55.03 
 
 		 170 aa  181  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.92 
 
 		 791 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  52.53 
 
 		 182 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  51.23 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  49.1 
 
 		 172 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  50.31 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  55.26 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  52.63 
 
 		 170 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  51.23 
 
 		 182 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.85 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.72 
 
 		 794 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.69 
 
 		 169 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.72 
 
 		 794 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 179 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 179 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 179 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 		 250 aa  177  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  48.5 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.95 
 
 		 792 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  49.38 
 
 		 172 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  57.45 
 
 		 169 aa  177  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 		 167 aa  177  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 		 166 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.78 
 
 		 793 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  54.09 
 
 		 193 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  54.67 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.97 
 
 		 167 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  59.29 
 
 		 170 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.03 
 
 		 183 aa  174  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  51.28 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  55.86 
 
 		 170 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  54.48 
 
 		 170 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  45.05 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  51.61 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.09 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  52.03 
 
 		 166 aa  173  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  51.61 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 		 199 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.68 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  50.33 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  50.33 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  49.68 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  51.32 
 
 		 174 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  50.67 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4742  NADH dehydrogenase subunit B  51.55 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578905  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.99 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  51.57 
 
 		 173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  51.68 
 
 		 165 aa  172  5e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  47.98 
 
 		 194 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>