More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2273 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
144 aa  296  5e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  91.91 
 
 
145 aa  263  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  83.8 
 
 
147 aa  259  8e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.69 
 
 
147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.45 
 
 
182 aa  188  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.16 
 
 
374 aa  186  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1001  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.45 
 
 
196 aa  173  9e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.846644  normal  0.110077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0336  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.84 
 
 
183 aa  172  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210833  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1957  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.45 
 
 
192 aa  170  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.93 
 
 
170 aa  170  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.01 
 
 
170 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  58.78 
 
 
174 aa  161  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.73 
 
 
171 aa  161  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  48.98 
 
 
245 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  49.3 
 
 
244 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
247 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
250 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
250 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 
246 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 
244 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 
244 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 
244 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 
250 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 
244 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  46.48 
 
 
235 aa  141  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 
244 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  46.48 
 
 
259 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 
252 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  51.11 
 
 
166 aa  140  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
249 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
249 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.48 
 
 
167 aa  140  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
186 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 
240 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  45 
 
 
173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.43 
 
 
176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.43 
 
 
176 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  43.45 
 
 
228 aa  134  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.53 
 
 
200 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  51.11 
 
 
167 aa  134  3.0000000000000003e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 
238 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  46.48 
 
 
168 aa  134  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.43 
 
 
200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
160 aa  133  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
160 aa  133  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.71 
 
 
200 aa  133  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  45.32 
 
 
211 aa  133  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  45.99 
 
 
185 aa  132  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.51 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0658  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.39 
 
 
293 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  44.6 
 
 
250 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  45 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.81 
 
 
170 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1924  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.39 
 
 
322 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  46.76 
 
 
158 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  48.51 
 
 
158 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0883  NADH dehydrogenase subunit B  43.7 
 
 
171 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000571038  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
158 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  43.26 
 
 
170 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.92 
 
 
191 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3598  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.71 
 
 
262 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  45.32 
 
 
207 aa  131  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0954  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.39 
 
 
322 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  48.23 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
172 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
179 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
179 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
179 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0517  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
172 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.81 
 
 
170 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
172 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
172 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
172 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
172 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3570  putative NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.71 
 
 
297 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  44.29 
 
 
190 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
172 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  44.29 
 
 
190 aa  130  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.63 
 
 
170 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
168 aa  130  6e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  44.29 
 
 
189 aa  130  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  43.57 
 
 
190 aa  130  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  45.26 
 
 
179 aa  130  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  48.51 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  43.88 
 
 
170 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  43.88 
 
 
172 aa  129  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  46.38 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 
195 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  42.75 
 
 
177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.86 
 
 
251 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>