More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0277 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  100 
 
 		 174 aa  357  5e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  56.52 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.94 
 
 		 323 aa  171  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.09 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  52.26 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.25 
 
 		 291 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.48 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.71 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  55.07 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  54.04 
 
 		 191 aa  167  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.39 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.85 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.46 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.41 
 
 		 200 aa  164  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.32 
 
 		 225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.89 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  56.82 
 
 		 166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.68 
 
 		 200 aa  163  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.48 
 
 		 145 aa  163  9e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  57.04 
 
 		 264 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 222 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 222 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.48 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  56.72 
 
 		 211 aa  161  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  51.27 
 
 		 245 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 222 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.78 
 
 		 144 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.38 
 
 		 251 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.22 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.19 
 
 		 793 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  54.96 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  54.96 
 
 		 268 aa  159  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.96 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.99 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  50.64 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  53.68 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  57.58 
 
 		 244 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.32 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.82 
 
 		 792 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  51.28 
 
 		 207 aa  158  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  51.66 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.19 
 
 		 791 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  51.7 
 
 		 244 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  51.66 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  51.66 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  49.01 
 
 		 794 aa  157  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  51.35 
 
 		 246 aa  157  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  53.15 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.66 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  56.03 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.66 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  56.03 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  51.7 
 
 		 244 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  58.21 
 
 		 195 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 		 249 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  52.9 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  49.35 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  51.7 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  55.88 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  45.88 
 
 		 247 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  50.36 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  51.7 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 		 249 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  49.67 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  49.67 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  58.21 
 
 		 195 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  51.68 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  51.68 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  48.7 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  51.91 
 
 		 250 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1213  NADH dehydrogenase subunit B  57.78 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  56.72 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  52.29 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  50.99 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  51.68 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.34 
 
 		 794 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  50.91 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  56.72 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  51.82 
 
 		 184 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.46 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1084  NADH dehydrogenase subunit B  57.78 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0355895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.46 
 
 		 158 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 		 250 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  56.72 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5810  NADH dehydrogenase subunit B  57.46 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  56.72 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  49.38 
 
 		 244 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  53.28 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  52.17 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.29 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  51.01 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  57.46 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 		 250 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>