More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0330 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  92.52 
 
 
147 aa  287  4e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.12 
 
 
145 aa  256  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.69 
 
 
144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.96 
 
 
182 aa  191  3e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.12 
 
 
374 aa  184  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1001  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.7 
 
 
196 aa  176  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.846644  normal  0.110077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0336  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.06 
 
 
183 aa  176  9e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210833  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1957  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.24 
 
 
192 aa  172  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.81 
 
 
170 aa  166  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.07 
 
 
170 aa  164  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.72 
 
 
171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  48.99 
 
 
174 aa  159  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  45.07 
 
 
191 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 
259 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
186 aa  141  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  45.83 
 
 
245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.37 
 
 
167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  45.71 
 
 
244 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  45.71 
 
 
246 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  45.83 
 
 
244 aa  138  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  44.6 
 
 
228 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  45.71 
 
 
244 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  45.71 
 
 
244 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  45.71 
 
 
244 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  45.71 
 
 
250 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
247 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  42.86 
 
 
250 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.89 
 
 
200 aa  137  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  45.71 
 
 
244 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
235 aa  137  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  42.86 
 
 
250 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
249 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
249 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  47.29 
 
 
211 aa  136  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  46.48 
 
 
166 aa  136  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  42.96 
 
 
173 aa  135  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
252 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  46.48 
 
 
177 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 
238 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.18 
 
 
200 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.48 
 
 
200 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
177 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
174 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  42.18 
 
 
158 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  46.76 
 
 
240 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  42.18 
 
 
158 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  44.85 
 
 
207 aa  134  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.48 
 
 
191 aa  133  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.86 
 
 
176 aa  133  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 
193 aa  133  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  45.07 
 
 
174 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  45.07 
 
 
176 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  45.07 
 
 
174 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
181 aa  132  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  41.5 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  46.48 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  41.5 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.38 
 
 
176 aa  131  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  43.84 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  46.81 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  42.96 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  43.17 
 
 
185 aa  131  3e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  41.22 
 
 
179 aa  131  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  44.53 
 
 
190 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.5 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  44.53 
 
 
190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
187 aa  130  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
175 aa  130  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  43.07 
 
 
190 aa  130  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
195 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.14 
 
 
251 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  44.53 
 
 
189 aa  130  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1213  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
195 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  41.89 
 
 
170 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1084  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
195 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0355895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  46.48 
 
 
192 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  46.97 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0883  NADH dehydrogenase subunit B  43.07 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000571038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.07 
 
 
180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  43.15 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  42.25 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  46.48 
 
 
204 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  46.48 
 
 
197 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2886  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
199 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.102099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  46.48 
 
 
195 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  43.54 
 
 
188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  42.47 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3299  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  43.8 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.66 
 
 
187 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  41.1 
 
 
158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  40.82 
 
 
184 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0658  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.83 
 
 
293 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.82 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2400  NADH dehydrogenase subunit B  45.77 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>