More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1079 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
171 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.15 
 
 
170 aa  234  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.29 
 
 
170 aa  231  3e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 
182 aa  180  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.09 
 
 
374 aa  177  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  49.09 
 
 
174 aa  171  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1957  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.41 
 
 
192 aa  170  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1001  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 
196 aa  169  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.846644  normal  0.110077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0336  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.91 
 
 
183 aa  164  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210833  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.72 
 
 
147 aa  164  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.72 
 
 
147 aa  162  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.73 
 
 
144 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.43 
 
 
145 aa  160  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.06 
 
 
191 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  48.2 
 
 
211 aa  149  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
186 aa  148  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
249 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
249 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
244 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
246 aa  147  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
244 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2919  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.92 
 
 
187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
244 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
250 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0779  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.348206  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  50.76 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.2 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 
193 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  49.63 
 
 
207 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  48.18 
 
 
173 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
177 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  52.17 
 
 
235 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  45.21 
 
 
173 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  45.21 
 
 
173 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  51.45 
 
 
247 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2572  NADH dehydrogenase subunit B  45.21 
 
 
173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
194 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  51.45 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
195 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  51.45 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
197 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2886  NADH dehydrogenase subunit B  48.89 
 
 
199 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.102099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
194 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.29 
 
 
167 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  45.95 
 
 
188 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
195 aa  144  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  49.63 
 
 
204 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
159 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  48.89 
 
 
202 aa  144  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  49.63 
 
 
188 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1084  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0355895 
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1213  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
159 aa  143  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3299  NADH dehydrogenase subunit B  48.89 
 
 
198 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  50.72 
 
 
244 aa  143  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  45.89 
 
 
172 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  45.32 
 
 
185 aa  143  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  50.72 
 
 
245 aa  143  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.91 
 
 
188 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2400  NADH dehydrogenase subunit B  48.89 
 
 
201 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.23 
 
 
188 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  43.79 
 
 
228 aa  142  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  46.76 
 
 
158 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4562  NADH dehydrogenase subunit B  48.15 
 
 
194 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  46.76 
 
 
158 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  48.18 
 
 
170 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  45.32 
 
 
179 aa  142  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4632  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 
194 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625417  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  45.24 
 
 
259 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
175 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.83 
 
 
291 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  46.1 
 
 
158 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  46.1 
 
 
158 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5810  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
185 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  47.06 
 
 
166 aa  141  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  47.71 
 
 
238 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  45.99 
 
 
191 aa  141  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  44.31 
 
 
240 aa  141  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  40.91 
 
 
173 aa  140  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.48 
 
 
158 aa  140  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  43.64 
 
 
182 aa  140  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  48.92 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  44.3 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  44.3 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  45.32 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  46.76 
 
 
181 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.18 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>