More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2012 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 170 aa  352  1e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  82.94 
 
 		 170 aa  313  5e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.15 
 
 		 171 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.05 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.93 
 
 		 144 aa  170  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  47.85 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.07 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.33 
 
 		 147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.74 
 
 		 374 aa  160  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1001  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.69 
 
 		 196 aa  159  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.846644  normal  0.110077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1957  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.34 
 
 		 192 aa  157  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0336  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.3 
 
 		 183 aa  157  8e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.25 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  47.22 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  46.81 
 
 		 188 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  49.29 
 
 		 244 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.55 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.3 
 
 		 169 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 249 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 		 259 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  48.23 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 249 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  49.29 
 
 		 244 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  51.88 
 
 		 246 aa  143  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  49.29 
 
 		 244 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  49.29 
 
 		 244 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.43 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.38 
 
 		 291 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.92 
 
 		 323 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  51.88 
 
 		 244 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  51.88 
 
 		 250 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  49.26 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  51.13 
 
 		 252 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  43.83 
 
 		 250 aa  140  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  50.74 
 
 		 193 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 		 169 aa  140  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  49.28 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  50.74 
 
 		 245 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  44.58 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  50.74 
 
 		 244 aa  140  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  46.85 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 		 250 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 		 250 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  50.38 
 
 		 235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 197 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0889  NADH dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 		 192 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  48.53 
 
 		 247 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  49.29 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  46.81 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  46.81 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.94 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.12 
 
 		 200 aa  137  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.83 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  49.26 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  47.71 
 
 		 238 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.15 
 
 		 200 aa  137  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1356  NADH dehydrogenase subunit B  49.28 
 
 		 188 aa  137  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118865  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  42.33 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1260  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0779  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.348206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  46.81 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1352  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  49.63 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  46.81 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.44 
 
 		 200 aa  137  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3299  NADH dehydrogenase subunit B  48.89 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  49.63 
 
 		 207 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  47.83 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.24 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.76 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2886  NADH dehydrogenase subunit B  48.89 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.102099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  48.53 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  47.86 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.38 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  47.41 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.65 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  45.39 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2398  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.2 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  45.32 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  48.89 
 
 		 202 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  48.51 
 
 		 268 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  48.53 
 
 		 240 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  48.51 
 
 		 268 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  50.39 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  46.1 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1276  NADH dehydrogenase subunit B  46.53 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2400  NADH dehydrogenase subunit B  48.89 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1377  NADH dehydrogenase subunit B  46.53 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.820361  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>