More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1381 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
181 aa  371  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.98 
 
 
181 aa  298  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  75.14 
 
 
182 aa  296  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  76.11 
 
 
180 aa  293  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  77.19 
 
 
187 aa  286  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  75.98 
 
 
180 aa  286  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.17 
 
 
230 aa  203  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  56.49 
 
 
168 aa  202  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  56.12 
 
 
183 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  54.68 
 
 
183 aa  190  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1291  NADH dehydrogenase subunit B  59.57 
 
 
183 aa  190  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378148  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.74 
 
 
183 aa  190  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  51.88 
 
 
182 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.94 
 
 
163 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.94 
 
 
163 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.94 
 
 
163 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.9 
 
 
170 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.22 
 
 
170 aa  187  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  60.28 
 
 
170 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1380  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
182 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1279  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
182 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 
193 aa  187  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2569  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
182 aa  187  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.95 
 
 
184 aa  187  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  49.37 
 
 
185 aa  187  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.61 
 
 
792 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  53.24 
 
 
184 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.96 
 
 
184 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  52 
 
 
184 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.25 
 
 
791 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  51.33 
 
 
184 aa  185  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  49.39 
 
 
174 aa  184  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
222 aa  184  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  50.32 
 
 
184 aa  184  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
222 aa  184  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  59.57 
 
 
170 aa  184  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  60.31 
 
 
222 aa  183  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.32 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.73 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.5 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4520  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.8 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  52 
 
 
213 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  47.85 
 
 
216 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.08 
 
 
184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.32 
 
 
202 aa  181  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.8 
 
 
793 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.52 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  52.82 
 
 
179 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.27 
 
 
226 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  48.67 
 
 
184 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.08 
 
 
183 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  48.67 
 
 
184 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  51.8 
 
 
213 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.7 
 
 
794 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.02 
 
 
794 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  50.67 
 
 
179 aa  177  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  49.04 
 
 
184 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.39 
 
 
183 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 
171 aa  176  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  48.43 
 
 
183 aa  176  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  47.24 
 
 
182 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 
180 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  51.39 
 
 
220 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
224 aa  175  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.34 
 
 
794 aa  175  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  48.37 
 
 
178 aa  175  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 
167 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
224 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  52.78 
 
 
225 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  52.78 
 
 
225 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  51.39 
 
 
220 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1014  NADH dehydrogenase subunit B  49.68 
 
 
221 aa  174  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.93 
 
 
787 aa  174  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  50.69 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  48.34 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  50.69 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  49.36 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3366  NADH dehydrogenase I, B subunit  52.08 
 
 
224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  49.33 
 
 
212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  52.08 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  52.08 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.07 
 
 
183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.19 
 
 
251 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1745  NADH dehydrogenase subunit B  52.08 
 
 
225 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440453  normal  0.328312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>