More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1604 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1604  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
178 aa  374  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1739  NADH dehydrogenase subunit B  85.39 
 
 
181 aa  332  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1219  NADH dehydrogenase subunit B  82.02 
 
 
180 aa  329  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0888  NADH dehydrogenase subunit B  75.29 
 
 
195 aa  296  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.330095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0377  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.41 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0166282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2208  NADH dehydrogenase subunit B  52.76 
 
 
213 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  45.31 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  38.27 
 
 
238 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  39.24 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  42.67 
 
 
247 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  46.88 
 
 
249 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  46.88 
 
 
249 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  38.04 
 
 
246 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  43.36 
 
 
240 aa  130  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  46.88 
 
 
252 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  40 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  39.33 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  47.66 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
244 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
244 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
244 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.26 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
244 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
250 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  38.69 
 
 
259 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  46.09 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  40.82 
 
 
190 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  46.88 
 
 
170 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  41.79 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40 
 
 
251 aa  124  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  46.09 
 
 
173 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.46 
 
 
225 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1116  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.01 
 
 
235 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.11 
 
 
169 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  44.7 
 
 
170 aa  122  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.65 
 
 
169 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.4 
 
 
170 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.73 
 
 
176 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  45.74 
 
 
170 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0551  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  43.51 
 
 
143 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  42.86 
 
 
174 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.97 
 
 
171 aa  122  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.88 
 
 
170 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1084  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  43.57 
 
 
154 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00491903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.41 
 
 
176 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  44.96 
 
 
170 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44 
 
 
182 aa  121  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.88 
 
 
170 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.49 
 
 
149 aa  121  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  42.86 
 
 
165 aa  121  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0593  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40 
 
 
164 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  39.46 
 
 
189 aa  121  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.41 
 
 
170 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  41.41 
 
 
250 aa  120  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  40 
 
 
184 aa  121  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3254  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.3 
 
 
235 aa  120  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.31 
 
 
323 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  41.73 
 
 
170 aa  120  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.61 
 
 
188 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1051  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.86 
 
 
190 aa  120  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  39.87 
 
 
268 aa  120  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.07 
 
 
144 aa  120  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  43.61 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.11 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  43.75 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  37.11 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1206  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.38 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  43.61 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  40.97 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.53 
 
 
291 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  44.19 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  38.78 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  43.61 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.09 
 
 
170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  42.64 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2455  ech hydrogenase subunit C  42.28 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0152532  normal  0.126862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  42.64 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  40.58 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  35.58 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.86 
 
 
147 aa  119  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.75 
 
 
188 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0705  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.1 
 
 
232 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0621219  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  39.31 
 
 
167 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  40 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  43.08 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0362  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.45 
 
 
160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.547425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1918  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.88 
 
 
229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.66 
 
 
183 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  37.34 
 
 
187 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0150  ech hydrogenase subunit C  42.28 
 
 
156 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>