More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2208 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2208  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1739  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 
181 aa  193  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210439  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0377  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.49 
 
 
180 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0166282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1219  NADH dehydrogenase subunit B  52.69 
 
 
180 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1604  NADH dehydrogenase subunit B  52.76 
 
 
178 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0888  NADH dehydrogenase subunit B  52.5 
 
 
195 aa  188  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.330095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  41.61 
 
 
245 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  48.18 
 
 
189 aa  145  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  44.79 
 
 
249 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.37 
 
 
176 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
190 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  45.26 
 
 
190 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
190 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
189 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
189 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  47.48 
 
 
244 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  41.98 
 
 
250 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  44.79 
 
 
249 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  41.98 
 
 
250 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  40.48 
 
 
268 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  47.45 
 
 
235 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  39.44 
 
 
264 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  43.45 
 
 
189 aa  142  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  42.41 
 
 
268 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
247 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  40.44 
 
 
240 aa  141  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  44.59 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  47.01 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46 
 
 
176 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  43.75 
 
 
177 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  42.6 
 
 
184 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  44.9 
 
 
166 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  44.24 
 
 
187 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  38.64 
 
 
259 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.16 
 
 
191 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  41.67 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.37 
 
 
196 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1051  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  35.75 
 
 
190 aa  135  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  39.16 
 
 
184 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.92 
 
 
251 aa  134  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  39.53 
 
 
238 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.48 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  42.66 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  41.89 
 
 
169 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  44.44 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  43.36 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.48 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  45.45 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  42.48 
 
 
170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  43.92 
 
 
170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  44.14 
 
 
170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  45.45 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  45 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  43.51 
 
 
167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  45.45 
 
 
174 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  44.06 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  44.06 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  44.29 
 
 
172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  41.83 
 
 
166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  44.06 
 
 
174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  39.08 
 
 
170 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  45.59 
 
 
177 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.48 
 
 
170 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  43.66 
 
 
228 aa  131  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3254  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.96 
 
 
235 aa  131  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2886  NADH dehydrogenase subunit B  43.36 
 
 
199 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.102099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3299  NADH dehydrogenase subunit B  43.36 
 
 
198 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.07 
 
 
794 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.6 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  42.36 
 
 
168 aa  131  9e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  44.06 
 
 
195 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  44.06 
 
 
197 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  41.83 
 
 
792 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1887  NADH dehydrogenase subunit B  40 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  36.9 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  44.76 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  43.06 
 
 
165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2400  NADH dehydrogenase subunit B  42.66 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  43.54 
 
 
173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1116  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.66 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  42.14 
 
 
794 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  44.53 
 
 
172 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.67 
 
 
188 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2220  NADH dehydrogenase subunit B  41.29 
 
 
202 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  47.3 
 
 
170 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>