More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0888 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0888  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
195 aa  408  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.330095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1739  NADH dehydrogenase subunit B  77.97 
 
 
181 aa  309  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1219  NADH dehydrogenase subunit B  78.61 
 
 
180 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1604  NADH dehydrogenase subunit B  75.29 
 
 
178 aa  296  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0377  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.64 
 
 
180 aa  231  6e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0166282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2208  NADH dehydrogenase subunit B  52.5 
 
 
213 aa  188  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.07 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.62 
 
 
251 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  36.81 
 
 
249 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  36.81 
 
 
249 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  38.89 
 
 
184 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0705  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.52 
 
 
232 aa  123  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0621219  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03191  NADH dehydrogenase subunit B  35.62 
 
 
252 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1116  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.31 
 
 
235 aa  122  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  37.2 
 
 
244 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1918  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.58 
 
 
229 aa  122  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  35.85 
 
 
246 aa  121  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  35.62 
 
 
244 aa  121  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  35.62 
 
 
250 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  39.73 
 
 
244 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  39.73 
 
 
244 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  39.73 
 
 
244 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3254  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.93 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  35.37 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3413  NADH dehydrogenase subunit B  39.74 
 
 
238 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  34.27 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1051  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.65 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  36.02 
 
 
190 aa  119  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  31.12 
 
 
245 aa  118  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  34.1 
 
 
240 aa  118  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4708  NADH dehydrogenase subunit B  33.91 
 
 
259 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146486  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  32.95 
 
 
244 aa  117  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  35.76 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  37.16 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  37.16 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  36.02 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  32.77 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1206  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.58 
 
 
175 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  34.3 
 
 
268 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0705  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  35.17 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.51 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.52 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  36.55 
 
 
268 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  37.32 
 
 
190 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  34.16 
 
 
189 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  32.96 
 
 
189 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1132  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.73 
 
 
149 aa  115  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  37.32 
 
 
190 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.58 
 
 
169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  34.59 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.08 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0593  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.86 
 
 
164 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  31.21 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.81 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.44 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.6 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1070  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.3 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.84 
 
 
225 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  36.77 
 
 
184 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.32 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  36.71 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  38.69 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.32 
 
 
170 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  36.99 
 
 
179 aa  111  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.74 
 
 
170 aa  111  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.24 
 
 
170 aa  111  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  35.22 
 
 
181 aa  111  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  39.74 
 
 
222 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  41.79 
 
 
173 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  39.74 
 
 
222 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  34.94 
 
 
167 aa  111  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  34.59 
 
 
182 aa  110  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  41.04 
 
 
170 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  37.58 
 
 
188 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  41.26 
 
 
177 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  34.01 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.66 
 
 
794 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  34.08 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  35.22 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0200  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  34.81 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.94 
 
 
170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  37.93 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.41 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.58 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.67 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3824  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  39.23 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4387  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.04 
 
 
323 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2588  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  43.7 
 
 
145 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.3 
 
 
200 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  38.31 
 
 
187 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0957  membrane bound hydrogenase subunit mbhJ  42.74 
 
 
143 aa  109  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0013552  normal  0.515096 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  34.67 
 
 
168 aa  109  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3526  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.52 
 
 
144 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.3 
 
 
200 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.4 
 
 
792 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  36 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.22 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  40.8 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  36.08 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  36.36 
 
 
170 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>