More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5099 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  79.78 
 
 		 180 aa  313  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  75.98 
 
 		 181 aa  298  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  74.72 
 
 		 180 aa  293  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  73.6 
 
 		 182 aa  291  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  71.19 
 
 		 187 aa  286  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  53.85 
 
 		 168 aa  198  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.72 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  53.85 
 
 		 183 aa  189  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  49.36 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1380  NADH dehydrogenase subunit B  55.1 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1279  NADH dehydrogenase subunit B  55.1 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2569  NADH dehydrogenase subunit B  55.1 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  49.33 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1291  NADH dehydrogenase subunit B  54.42 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.96 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.14 
 
 		 169 aa  184  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.66 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  56.83 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  46.54 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  51.08 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.61 
 
 		 791 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  48.08 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  48.08 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.75 
 
 		 163 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.75 
 
 		 163 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.75 
 
 		 163 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.8 
 
 		 793 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  56.74 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.29 
 
 		 792 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.86 
 
 		 794 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  49.32 
 
 		 174 aa  179  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.79 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.08 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.79 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.36 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  45.96 
 
 		 216 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.14 
 
 		 794 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 		 202 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  49.64 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  56.03 
 
 		 170 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  49.33 
 
 		 213 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  50.68 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  51.8 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  47.26 
 
 		 167 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 222 aa  176  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  48.63 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.08 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  51.41 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.54 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  47.13 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4520  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.07 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.67 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  47.26 
 
 		 167 aa  175  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  45.89 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.42 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.97 
 
 		 251 aa  174  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 159 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 159 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  49.34 
 
 		 159 aa  174  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.37 
 
 		 180 aa  173  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  47.26 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  47.65 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  50.36 
 
 		 264 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  51.85 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.67 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  49.34 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  46.58 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  49.31 
 
 		 171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.39 
 
 		 194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  50.36 
 
 		 271 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  48.68 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  52.9 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.41 
 
 		 794 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  51.63 
 
 		 159 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.33 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  53.33 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 		 158 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.92 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  53.69 
 
 		 264 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1014  NADH dehydrogenase subunit B  50.71 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  50.33 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.67 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.29 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  50.97 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.01 
 
 		 200 aa  167  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  50.75 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  50.75 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  50.7 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  50.75 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  50.75 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>