165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1630 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 114 aa  223  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  57.89 
 
 		 114 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  34.21 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.93 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.55 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.26 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  34 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.93 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.58 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.36 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.53 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21.57 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.36 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  22.55 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 117 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 117 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.58 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3391  anti-anti-sigma factor  32.1 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  22.22 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  34.41 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.53 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  32.38 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.02 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.7 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.91 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.72 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  24.32 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.04 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>