104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1833 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 135 aa  270  6e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  40.82 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.54 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  41.49 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.78 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.97 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  41.43 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  34.45 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.41 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  36.63 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.89 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  40.24 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 203 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.28 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  28.1 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.96 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.87 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  18.63 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  31.67 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.73 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3391  anti-anti-sigma factor  31.68 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  31.96 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.96 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  30.23 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  23.64 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  32.56 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13130  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  37.65 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35180  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  30.48 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 		 109 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  36.07 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 112 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.78 
 
 		 151 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  28.71 
 
 		 123 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  21.21 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  36.21 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  26.96 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  30.56 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  30.56 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1771  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.61 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  33.71 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.09 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.07 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 405 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>