299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5320 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
115 aa  229  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  90.43 
 
 
117 aa  210  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  88.89 
 
 
116 aa  190  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  87.04 
 
 
116 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  77.39 
 
 
117 aa  178  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  75.89 
 
 
113 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  76.15 
 
 
113 aa  167  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  76.15 
 
 
113 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  73.39 
 
 
113 aa  158  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  70.48 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  66.97 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  44.74 
 
 
120 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  50.46 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  53.7 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  54.63 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 
118 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  42.06 
 
 
116 aa  94  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  47.62 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  44.12 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  39.05 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  37.11 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.84 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  37.17 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.11 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  37.74 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  36.08 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.08 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.08 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.08 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.08 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  36.79 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.08 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 
249 aa  70.1  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  33.66 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  34.38 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36.46 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  34.23 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  36 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  39.25 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 
110 aa  67  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.99 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  28.43 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  40.43 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.23 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 
170 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  33.94 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  30.91 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  30.91 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
250 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.47 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  38.27 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  30 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  30 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>