More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4828 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
117 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  81.08 
 
 
116 aa  179  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  77.39 
 
 
115 aa  178  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  80.18 
 
 
116 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  76.07 
 
 
117 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  77.98 
 
 
113 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  75.44 
 
 
113 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  76.15 
 
 
113 aa  163  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  85.26 
 
 
113 aa  163  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  70.75 
 
 
122 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  70.27 
 
 
112 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  49.49 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  56.84 
 
 
111 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  54.76 
 
 
111 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  45.79 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  55.95 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  38.39 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  50 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.5 
 
 
112 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.5 
 
 
112 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  37.5 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.5 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.5 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  47.87 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.5 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.5 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.5 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  39.81 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.45 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  36.61 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  37.38 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  35.45 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  37.38 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36.63 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.34 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  36.63 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.04 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.63 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  39.53 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.98 
 
 
122 aa  66.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  30.61 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.68 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  29 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.08 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  35.35 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.08 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  32.22 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  32.22 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 
250 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.53 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>