191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3867 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  100 
 
 
114 aa  228  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  57.02 
 
 
121 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  47.27 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  45.37 
 
 
121 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38.6 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  39.25 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2076  anti-anti-sigma factor family protein  36.54 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.54 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  40 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  35.78 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  35.42 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 
110 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 
102 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  24.32 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 
109 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.41 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  23.81 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  26.26 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.26 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  31.58 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  34.74 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  34.41 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 
115 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 
110 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 
117 aa  50.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.97 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  40.32 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  26.42 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.37 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  32.39 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 
846 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.89 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.27 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  23.15 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.18 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  34.52 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  25.23 
 
 
111 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.23 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  25.23 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.23 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.58 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>