232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0901 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
112 aa  223  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  95.5 
 
 
111 aa  216  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  93.75 
 
 
112 aa  214  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  92.86 
 
 
112 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  94.59 
 
 
111 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  92.86 
 
 
112 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  94.59 
 
 
111 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  90.99 
 
 
111 aa  207  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  90.18 
 
 
112 aa  207  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  90.09 
 
 
111 aa  206  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  43.4 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  42.45 
 
 
108 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  42.45 
 
 
108 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.58 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  33.94 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  33.04 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  39.08 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  38.64 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  35.96 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  36.05 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  36.05 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  39.19 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  32.91 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  31.52 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  29.55 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  25 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  34.83 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.89 
 
 
105 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  27.5 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  23.64 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  30 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  27.47 
 
 
183 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  24.27 
 
 
122 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
117 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.92 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  32.47 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>