189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0024 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.43 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 250 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.89 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  29.89 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  32.22 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.89 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.74 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.89 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  32.22 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.33 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.53 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  23.66 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 269 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26.37 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.74 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.74 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  31.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  31.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  28.74 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  31.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  31.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  34.88 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.74 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  31.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  31.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  31.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  22 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  27.38 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  24.53 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  29.27 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.75 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.84 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  25.27 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  28.42 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  24.74 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  31.71 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.19 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  31.08 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  31.08 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.86 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.47 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  25.26 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34950  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  34.48 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0660877  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.19 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  31.71 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  31.71 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>