239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1430 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  71.17 
 
 		 113 aa  168  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  68.14 
 
 		 113 aa  167  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  56.36 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  33.93 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  38.27 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.87 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.63 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  34.94 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  34.52 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  40.26 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  32.94 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  39.73 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  41.94 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  34.67 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.34 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  38.98 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.03 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.49 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.41 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  39.68 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.21 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.75 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.3 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.11 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  45.16 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1245  anti-sigma-factor antagonist  21.7 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  32.35 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.36 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  25.74 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.41 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.1 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.31 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  33.77 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  30.43 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.99 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  27.85 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.79 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 405 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>