267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0996 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  100 
 
 		 112 aa  217  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  41.28 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  39.64 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  40.19 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  40.37 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  33.94 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.86 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  34.95 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  32.41 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  33.03 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  39.78 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  39.78 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  39.09 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  44.44 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  43.93 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  40 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  44.83 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  37.25 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  37.25 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.62 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  37.89 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  31.68 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  31.68 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  34.74 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  39.25 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.92 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  34.65 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  25.27 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  36.36 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.29 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  36.26 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.7 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  27.66 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>