103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2644 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 107 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.45 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  34.65 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.36 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.98 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.52 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.61 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  34.26 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  37.86 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  34.69 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33.01 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  40.7 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.37 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.07 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  37.88 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4774  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  37.78 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.34 
 
 		 249 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.32 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  24.04 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.93 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.89 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  29.81 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  26.42 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  22.77 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  25.53 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  30.12 
 
 		 375 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.47 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 151 aa  42  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  23.3 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2858  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.49 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  23.6 
 
 		 115 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2687  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 104 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 119 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.9 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.26 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  23.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  23.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  32.56 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3325  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3387  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.630266  normal  0.0247745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>