219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2116 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 119 aa  226  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  71.17 
 
 		 114 aa  153  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  48 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  47.83 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  45.83 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  40.82 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  44.19 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41.41 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  46.59 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  43.62 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  40.4 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  42.35 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  42.86 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  40.66 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  40.86 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  39.36 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  46.43 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  41.57 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  51.58 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  35.11 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  36.96 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  36.96 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  41.49 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  42.27 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  43.48 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  34.44 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  45.56 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  27.59 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  27.59 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  29.29 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3599  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4424  anti-sigma-factor antagonist  45.61 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  28.28 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  28.12 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  38.1 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.44 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.79 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  26.44 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.44 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.44 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.44 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  25.29 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.29 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.98 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  38.16 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.35 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.29 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  33.85 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.19 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3674  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.629343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  36.54 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21.18 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>