127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4407 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 127 aa  239  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  45.12 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  45.97 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  37.39 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  36.59 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  37 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  34.62 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.86 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  35.19 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  22.45 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  43.66 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  39.71 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5015  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.43 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  35.58 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  17.65 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  23.16 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  20.37 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  20.37 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  23.91 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  23.91 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  23.47 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  21.36 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.53 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.73 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 249 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.91 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.91 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.91 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  27.62 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  26.67 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.29 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  28 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  22.83 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.08 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 		 429 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.29 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.7 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  20.45 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  33.03 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.91 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  28.72 
 
 		 107 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 		 114 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 108 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 113 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>