32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2530 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
155 aa  314  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  67.76 
 
 
155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  51.37 
 
 
148 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  51.37 
 
 
148 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  51.37 
 
 
148 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  39.2 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  36.43 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  36.43 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  36.43 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  39.45 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  45.05 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  34.69 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0343  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  32.98 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  34.26 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  31.19 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  28.87 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  27.84 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.26 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>