31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0702 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 152 aa  310  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  81.21 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  48.76 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  48.76 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  48.76 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  44 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  39.2 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  45.36 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  45.36 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  45.36 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  40.96 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  34.58 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  36.05 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  29.03 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  30.14 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0343  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>