37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1311 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  98.58 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  98.58 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  59.56 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  53.12 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  43.65 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  43.65 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  43.65 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  36.43 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  38.79 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  42.72 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  42.72 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  42.72 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  42.72 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  43.02 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  43.01 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  43.37 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  39.36 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  39.36 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  39.36 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  34.82 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  39.58 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  28.33 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.84 
 
 		 129 aa  43.9  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  27.55 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  29.73 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  31.3 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  34.91 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  27.55 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.87 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  35.51 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  29.41 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 127 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>