192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5403 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 118 aa  225  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  41.96 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  47 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  40.57 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  43.82 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  40.19 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  37.39 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  30.17 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.38 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  41.3 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  39.58 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  40.86 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  30.63 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4424  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.27 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.63 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  36.36 
 
 		 505 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.62 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 436 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.13 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  40.45 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2472  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.09 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  35.29 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  29.59 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  39.18 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  34.31 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  33.66 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  42.17 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  40.96 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.34 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  32.38 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.37 
 
 		 437 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  35.58 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  25.26 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  35.71 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2399  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.09 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>