188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5360 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 138 aa  260  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  47.27 
 
 		 114 aa  97.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.71 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  41.28 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  41.96 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  42.06 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  37.76 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  42.57 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  37.5 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  43.88 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  48.05 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  37 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  39.05 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  39.58 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  41.75 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  47.19 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  38.68 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  42.55 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  41.76 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  36.27 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  37.37 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  40.21 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38.61 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  33.01 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  35.58 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  41.38 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  41.18 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38.61 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.27 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  34.96 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  30.93 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  32.46 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  24.74 
 
 		 102 aa  50.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  39.39 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  26.26 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  26.26 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  35.09 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  35.65 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  26.79 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.25 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  38.82 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  31.33 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  25.86 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  39.33 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>