105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3738 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 121 aa  231  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  45.87 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  45.12 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  40.78 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  44.44 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  40.71 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  36.27 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  45.65 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2472  anti-sigma-factor antagonist  39.47 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  43.42 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  39.47 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  29.73 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  38.53 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  30.28 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.23 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.56 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  25.74 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  25.74 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.78 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.76 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  33.65 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  24.51 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  34.44 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  25.24 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4424  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  22 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  42.47 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  26.55 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  23.76 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.69 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  22.61 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  21.43 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  17.39 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  24.04 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  26.67 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  31.25 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.63 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  27.62 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  25 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  29.41 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  31.63 
 
 		 555 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  26.19 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12656  hypothetical protein  29.91 
 
 		 148 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  26.21 
 
 		 115 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  28 
 
 		 429 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  35.09 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  20.56 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3599  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>