37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12656 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12656  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  52.38 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  57.14 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  36.36 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.36 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.96 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  28.21 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  20.39 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 128 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 121 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  23.53 
 
 		 99 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4424  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  22.41 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  30 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>