227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1941 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  79.28 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  75.68 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  70.27 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  71.96 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  71.96 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  72.53 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  51.58 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  49.55 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  51.06 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  50 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  45.54 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  47.32 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  63.24 
 
 		 80 aa  87  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  28.7 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.44 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  34.52 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.59 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  42.65 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.67 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  31.52 
 
 		 112 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  33.71 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  41.43 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  39.71 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  30.68 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  25.23 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  26.47 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.84 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  29.17 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  26.55 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 249 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  24.73 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4115  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0231593  normal  0.0203819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.74 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  26.67 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.67 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 110 aa  48.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  30 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  31.34 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  33.75 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  37.7 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  31.58 
 
 		 505 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  27.55 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 250 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.85 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>