165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2083 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  100 
 
 		 183 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.36 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  28.83 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  29.59 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  24.3 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  23.3 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 116 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  24.49 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.96 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  27.66 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.67 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  27.18 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  30.23 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  27.08 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.67 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.23 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.23 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.76 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.07 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  28.57 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.74 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  22.41 
 
 		 120 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 109 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.07 
 
 		 112 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  23.81 
 
 		 111 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 111 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  24.04 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  28.45 
 
 		 116 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 112 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 110 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  25.86 
 
 		 114 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 100 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  25.86 
 
 		 116 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  23.66 
 
 		 132 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 105 aa  51.2  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 110 aa  51.6  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.55 
 
 		 112 aa  51.2  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 110 aa  51.2  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 250 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.55 
 
 		 112 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 110 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 		 116 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  29.35 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 269 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  20.91 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 111 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 111 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  23.96 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  22.92 
 
 		 115 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 122 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  20.72 
 
 		 117 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.17 
 
 		 117 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 114 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 111 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  20.39 
 
 		 123 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 117 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  20.59 
 
 		 117 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 113 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 117 aa  48.5  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 112 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  24 
 
 		 112 aa  48.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 142 aa  48.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  22.83 
 
 		 116 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0915  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 116 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  25.29 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>